Zij houdt de identiteit van de school nauwlettend in de gaten en besteedt de overheidsmiddelen volgens de wet en regelgeving. Kenmerkend voor het toezichthoudend bestuur is de ontmenging van “bestuur” en “dagelijkse leiding”.
Het bestuur bestuurt en legt de dagelijkse leiding van de organisatie in handen van een andere “laag” in de organisatie, in het geval van de Stichting NIS de algemeen directeur (zie paragraaf 2.3). Het toezichthoudend bestuur is lid van de PO-Raad. De PO-Raad is de brancheorganisatie voor het primair onderwijs. Deze vereniging behartigt de gemeenschappelijke belangen van de besturen in het basisonderwijs, speciaal basisonderwijs en (voortgezet) speciaal onderwijs. De PO-Raad richt zich op de drie grote domeinen: bekostiging, werkgeverschap en de hoofdlijnen van het onderwijsbeleid.
De Stichting heeft twee scholen onder haar beheer: de El Amien I in Osdorp en de El Amien II in Bos en Lommer (twee vestigingen). Aan beide scholen zijn peutergroepen verbonden.
Het toezichthoudend bestuur van El Amien bestaat uit 6 leden: